oncomine，oncomine数据库怎么读

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一文章核心内容 文章主要研究了E2F基因家族在肺癌LC中的表达模式和预后价值E2F是高等真核生物中编码转录因子家族的一组基因，参与哺乳动物细胞的细胞周期调控和DNA合成作者通过OncomineGEPIAKaplanMeier Plotter和cBioPortal等在线数据库，分析了E2Fs在LC患者中的转录和存活数据，并得出了以下；注册访问Oncomine官方网站，点击“Register”进行注册填写相关信息，如姓名邮箱密码等，完成注册流程登录使用注册时填写的邮箱和密码登录Oncomine平台三数据库浏览与搜索 浏览数据集登录后，用户可以浏览Oncomine平台上的各种数据集这些数据集按照癌症类型组织类型实验条件等进行分类搜索数。

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首先，图1展示了在不同肿瘤类型中C1ORF112的表达水平在Human Protein Atlas数据库中，通过分子搜索并筛选Tissue，可以获取图1A的数据UCSC Genome Browser提供了图1B的相应信息，而Oncomine数据库不再可用，但仙桃学术能帮助完成类似分析，获取泛癌样本的C1ORF112表达数据图2揭示了C1ORF112表达与；文章共包含9张图表和一张表格，数据扎实，证明了作者的严谨性复现内容包括E2Fs在乳腺癌的转录水平基因表达与临床参数的关系，以及预后分析等，涉及工具包括仙桃学术工具OncomineKMplotter等跟着复现步骤，我们先从Oncomine获取E2Fs在乳腺癌中的表达数据，然后利用Snipaste等工具获取高分辨率图片。

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Oncomine数据库用途探索特定基因在肿瘤与正常组织中的表达差异操作方法在搜索框中输入基因名，点击搜索，截取结果图的部分区域Timer数据库用途分析基因表达差异免疫浸润相关性等操作方法选择“Diff Exp”模块输入基因名进行分析，或选择其oncomine他模块分析免疫细胞相关性仙桃学术工具用途高级。

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在众多数据库中，我们已经为大家介绍了以肿瘤研究为主的TCGA和Oncomine对于非肿瘤研究领域，我们推荐以下数据库1 RGD Disease数据库 网址 是否需要注册是 所属分类综合性数据库 功能涵盖包括肿瘤血液病心血管糖尿病神经系统免疫等各类疾病，提供基因信息。

8 转录组数据库 简介包括OncomineGEO和ArrayExpress等 内容分析肿瘤基因表达模式和差异，有助于揭示癌症发生过程中的基因表达变化9 蛋白组数据库 简介如CPTACCancer3D和CancerPPD等 内容关注蛋白质结构功能和变异对癌症的影响，为蛋白质层面的癌症研究提供数据支持10 药物相关数据。

Oncomineoncomineorg特别适用于差异分析，提供了丰富的癌症基因表达数据GEPIAgepiacancerpkucn专注于共表达分析，对于理解基因间相互作用提供独特的视角TIMER是进行免疫浸润分析的绝佳选择，帮助研究者探索肿瘤微环境HCCDBlifeomenetdatabasehcc专门。

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通过Oncomine数据库，我们可以看到COL10A1在乳腺癌中的表达水平显著高于正常组织图2** COL10A1表达与乳腺癌临床指标的关系 利用bcgene expression miner数据库，我们分析了COL10A1表达与年龄SBR等级雌激素受体ER孕激素受体PR人表皮生长因子受体2HER2淋巴结状态基底样状态和三。

肿瘤转录组数据库 ArrayExpressEMBLEBI的基因组学实验数据仓库，包含丰富的转录组数据，有助于研究人员分析基因表达模式 Oncomine大型肿瘤基因芯片数据库，提供基因表达数据的深入分析功能，有助于发现肿瘤相关的基因表达差异这些数据库各有特色，研究人员可根据具体研究需求选择合适的数据库资源。

1选择“文件”选项卡，单击“关闭数据库”命令2选择“文件”选项卡，单击“退出”命令3单击数据库窗口标题栏的“关闭”按钮4双击“控制”按钮5按Alt+F4组合键。

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